MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 9886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011989	TAA	2	6	422663	422668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011989	TGAC	2	8	422724	422731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_011989	CTGA	2	8	427118	427125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_011989	TCCT	2	8	428783	428790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_011989	CAT	2	6	428875	428880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_011989	T	6	6	428911	428916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011989	GCT	2	6	429295	429300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_011989	TGT	2	6	429313	429318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011989	TTC	2	6	433429	433434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_011989	GCA	2	6	433445	433450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_011989	AAT	2	6	433455	433460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011989	TAT	2	6	433490	433495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011989	AGC	2	6	433517	433522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_011989	GAG	2	6	435788	435793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011989	ATT	2	6	435853	435858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011989	TCC	2	6	435893	435898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_011989	ATGG	2	8	436506	436513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011989	CCGCG	2	10	436535	436544	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1019	NC_011989	ACC	2	6	439751	439756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_011989	GGA	2	6	439829	439834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011989	CAAG	2	8	442096	442103	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_011989	ATG	2	6	442142	442147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011989	ATG	2	6	442193	442198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011989	TGT	2	6	442237	442242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011989	CTG	2	6	442251	442256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_011989	GGA	2	6	442277	442282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011989	CGG	2	6	445437	445442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_011989	GCC	2	6	446707	446712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_011989	ATC	2	6	447803	447808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_011989	ATG	2	6	447825	447830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011989	TCC	2	6	447853	447858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_011989	T	6	6	447941	447946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_011989	G	7	7	447950	447956	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011989	C	6	6	447975	447980	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1035	NC_011989	CCG	2	6	449227	449232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_011989	GC	4	8	449261	449268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_011989	AT	3	6	449279	449284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011989	GCCT	2	8	449291	449298	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_011989	CG	3	6	449335	449340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_011989	GCA	2	6	449367	449372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_011989	AGA	2	6	449429	449434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011989	TGGC	2	8	450165	450172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_011989	TTC	2	6	450175	450180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_011989	TCCAA	2	10	453245	453254	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1045	NC_011989	ACGG	2	8	453257	453264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_011989	AAT	2	6	453310	453315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011989	CT	3	6	453341	453346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_011989	AGA	2	6	453361	453366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011989	CGA	2	6	453368	453373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011989	CTCC	2	8	455146	455153	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1051	NC_011989	TGA	2	6	455160	455165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011989	TAA	2	6	455231	455236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011989	AAT	2	6	455270	455275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_011989	ACA	2	6	455329	455334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_011989	AACC	2	8	455361	455368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_011989	AGG	2	6	455410	455415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011989	CAC	2	6	455732	455737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_011989	AATA	2	8	455740	455747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_011989	ATTT	2	8	458895	458902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011989	ATG	2	6	458930	458935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011989	ATT	2	6	458973	458978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_011989	TCT	2	6	461230	461235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_011989	GGA	2	6	461248	461253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011989	AAC	2	6	461287	461292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_011989	A	7	7	461892	461898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011989	CTT	2	6	462341	462346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_011989	TAAGGT	2	12	462381	462392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1069	NC_011989	AAT	2	6	462415	462420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_011989	CAA	2	6	462425	462430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_011989	A	6	6	462461	462466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011989	T	6	6	462483	462488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011989	GGC	2	6	462507	462512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_011989	CG	3	6	462591	462596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_011989	TA	3	6	462631	462636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011989	TGC	2	6	462637	462642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1078	NC_011989	CCT	2	6	462673	462678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_011989	A	7	7	463942	463948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_011989	TTGC	2	8	464066	464073	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_011989	GC	3	6	464140	464145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_011989	TCGGCG	2	12	464151	464162	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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1085	NC_011989	AAT	2	6	465426	465431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011989	GT	3	6	465450	465455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_011989	ACC	2	6	466724	466729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_011989	ATT	2	6	466739	466744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_011989	TTG	2	6	466746	466751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011989	TTG	2	6	466786	466791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_011989	CAGA	2	8	466865	466872	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_011989	CA	3	6	467713	467718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_011989	CCT	2	6	468510	468515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_011989	ATA	2	6	468534	468539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011989	AT	3	6	469356	469361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011989	A	6	6	469368	469373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011989	AGG	2	6	469386	469391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011989	GA	3	6	470376	470381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011989	GCA	2	6	470406	470411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_011989	CGT	2	6	470412	470417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_011989	T	6	6	471806	471811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011989	TAT	2	6	471828	471833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011989	ATTTT	2	10	471841	471850	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011989	TAAAA	2	10	471862	471871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011989	TCGTGA	2	12	471896	471907	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1106	NC_011989	TTGA	2	8	471918	471925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011989	ATG	2	6	471936	471941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011989	CAT	2	6	471977	471982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_011989	GCA	2	6	471985	471990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_011989	GCA	3	9	472025	472033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_011989	GTC	2	6	472117	472122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_011989	AC	3	6	473098	473103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_011989	GTTTTT	2	12	473153	473164	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011989	GCC	2	6	474245	474250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_011989	AGG	2	6	474343	474348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011989	TGA	2	6	474908	474913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011989	T	7	7	474922	474928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011989	TAT	2	6	474984	474989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011989	GGC	2	6	475127	475132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_011989	GCC	2	6	475159	475164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_011989	AAG	2	6	475182	475187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011989	GTT	2	6	475209	475214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011989	CGCGC	2	10	475418	475427	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1124	NC_011989	GGC	2	6	475440	475445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_011989	ATG	2	6	475530	475535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_011989	TGG	3	9	475663	475671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_011989	AGA	2	6	475743	475748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011989	ATC	2	6	475791	475796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_011989	GAT	2	6	475815	475820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1131	NC_011989	GGC	2	6	475863	475868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_011989	ATT	2	6	475959	475964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011989	CAT	2	6	476025	476030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1135	NC_011989	ACA	2	6	476878	476883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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